ID supermatcher-wordlen7
AP supermatcher
CL ../../data/tropomyosin.fasta ../../data/aligna.dna
CL -gapextend 1 -wordlen 7 -outfile align -auto
FI supermatcher.error
FP /.*BG089808/
FP /.*BG147728/
FI align
FZ = 2850
FP /Score: 41.0/
FP /BE848719         102 ggtgttaaaacagtactcttctggttt-----agttt    133/
FP /                     ||| |||||||      |....|||||     |.|||/
FP /AFULL             20 ggt-ttaaaac------cccggggttttcccaaattt     49/
FP /Score: 42.0/
FP /AFULL             31 ccggggttttcccaaatttgggcc     54/
FP /                     ||||||  |.|||.||     |||/
FP /BI817778           1 ccgggg--taccctaa-----gcc     17/
FP /Score: 55.0/
FP /.*   3 gtaacc-------ggttaaacccg-ggtttaaaaccccggggttttccca     44/
FP /.*     ||.|||       |||    .||| ||   ||||.|      .|..|||./
FP /.* 740 gtgacctgaaggaggt----gccgcgg---aaaaac------atcaccct    776/
FP /AFULL             45 aatt-------tgggccaattggc     61/
FP /                     .|||       |||||||  ||||/
FP /AF310722         852 cattcggggtctgggcca--tggc    873/
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