Description: Add_version
--- /dev/null
+++ b/VERSION
@@ -0,0 +1 @@
+0.10.2
--- a/Makefile
+++ b/Makefile
@@ -95,39 +95,39 @@
 
 $(AGN_OBJS):	obj/%.o : src/core/%.c inc/core/%.h inc/core/AgnVersion.h
 		@- mkdir -p obj
-		$(CC) $(CFLAGS) $(INCS) -c -o $@ $<
+		$(CC) $(CPPFLAGS) $(CFLAGS) $(INCS) -c -o $@ $<
 
 $(VN_OBJS):	obj/%.o : src/VAnG/%.c inc/VAnG/%.h inc/core/AgnVersion.h
 		@- mkdir -p obj
-		$(CC) $(CFLAGS) $(INCS) -c -o $@ $<
+		$(CC) $(CPPFLAGS) $(CFLAGS) $(INCS) -c -o $@ $<
 		
 $(PE_EXE):	src/ParsEval/parseval.c src/ParsEval/pe_options.c src/ParsEval/pe_utils.c src/ParsEval/pe_options.h src/ParsEval/pe_utils.h $(AGN_OBJS)
 		@- mkdir -p bin
-		$(CC) $(CFLAGS) $(INCS) -I src/ParsEval -o $@ $(AGN_OBJS) src/ParsEval/parseval.c src/ParsEval/pe_options.c src/ParsEval/pe_utils.c $(LDFLAGS)
+		$(CC) $(CPPFLAGS) $(CFLAGS) $(INCS) -I src/ParsEval -o $@ $(AGN_OBJS) src/ParsEval/parseval.c src/ParsEval/pe_options.c src/ParsEval/pe_utils.c $(LDFLAGS)
 
 $(CN_EXE):	src/canon-gff3.c $(AGN_OBJS)
 		@- mkdir -p bin
-		$(CC) $(CFLAGS) $(INCS) -o $@ $(AGN_OBJS) src/canon-gff3.c $(LDFLAGS)
+		$(CC) $(CPPFLAGS) $(CFLAGS) $(INCS) -o $@ $(AGN_OBJS) src/canon-gff3.c $(LDFLAGS)
 		
 $(VN_EXE):	src/VAnG/vang.c $(VN_OBJS)
 		@- mkdir -p bin
-		$(CC) $(CFLAGS) $(INCS) -o $@ $(VN_OBJS) src/VAnG/vang.c $(LDFLAGS)
+		$(CC) $(CPPFLAGS) $(CFLAGS) $(INCS) -o $@ $(VN_OBJS) src/VAnG/vang.c $(LDFLAGS)
 
 $(LP_EXE):	src/locuspocus.c $(AGN_OBJS)
 		@- mkdir -p bin
-		$(CC) $(CFLAGS) $(INCS) -o $@ $(AGN_OBJS) src/locuspocus.c $(LDFLAGS)
+		$(CC) $(CPPFLAGS) $(CFLAGS) $(INCS) -o $@ $(AGN_OBJS) src/locuspocus.c $(LDFLAGS)
 
 $(XT_EXE):	src/xtractore.c $(AGN_OBJS)
 		@- mkdir -p bin
-		$(CC) $(CFLAGS) $(INCS) -o $@ $(AGN_OBJS) src/xtractore.c $(LDFLAGS)
+		$(CC) $(CPPFLAGS) $(CFLAGS) $(INCS) -o $@ $(AGN_OBJS) src/xtractore.c $(LDFLAGS)
 
 $(RP_EXE):	src/pmrna.c $(AGN_OBJS)
 		@- mkdir -p bin
-		$(CC) $(CFLAGS) $(INCS) -o $@ $(AGN_OBJS) src/pmrna.c $(LDFLAGS)
+		$(CC) $(CPPFLAGS) $(CFLAGS) $(INCS) -o $@ $(AGN_OBJS) src/pmrna.c $(LDFLAGS)
 
 $(UT_EXE):	test/unittests.c $(AGN_OBJS)
 		@- mkdir -p bin
-		$(CC) $(CFLAGS) $(INCS) -o $@ $(AGN_OBJS) test/unittests.c $(LDFLAGS)
+		$(CC) $(CPPFLAGS) $(CFLAGS) $(INCS) -o $@ $(AGN_OBJS) test/unittests.c $(LDFLAGS)
 
 libaegean.a:	$(AGN_OBJS)
 		ar ru libaegean.a $(AGN_OBJS)
